Thème génétique - TP 5 : Enzymes de restriction et découpage de l'ADN

1- Lien pour télécharger le logiciel utilisé lors du TP

Page de présentation du logiciel ADN

2- Pour faire plus ample connaissance avec les bactériophages

2-1 Une présentation rapide des bactériophages...

2-2 Quelques animations

Animation A : Attachment of the bacteriophage to the cell wall of a bacterium.

Animation B : The bacteriophage injects its genome into the bacterium.

Animation C : Replication of the viral genome.

Animation D : Bacteriophages are released by lysis.

Animation E : Summary of the entire lytic life cycle of a bacteriophage.


3- Pour faire plus ample connaissance avec Eco RI

Eco RI est une  nucléase, c'est à dire une enzyme spécialisée dans la dégradation des acides nucléiques.
Il existe deux catégories de nucléases selon leur mode d'action : les exonucléases qui dégradent par excision du nucléotide situé en extrémité de chaîne (souvent en 3') et les endonucléases qui coupent des liaisons phosphodiester dans la chaîne.
Parmi les endonucléases, certaines sont non spécifiques et hydrolysent des liaisons phosphodiester au hasard, d'autres présentent une remarquable spécificité de site.






Exemple de la coupure de l'ADN par Eco RI (Source = "devoir maison" de la synthèse)


Voir une modélisation de l'action de Eco RI.


4- D'autres  enzymes de restriction...

Nucléase	Source (rappelée dans le nom de l'enzyme)	Site reconnu	Nucléase	Source (rappelée dans le nom de l'enzyme)	Site reconnu
Hæ III	Hæmophilus ægyptus	G G C C C C G G	Hpa II	Hæmophilus parainfleuenzæ	C C G G G G C C
Mbo I	Moraxella bovis	G A T C C T A G	Taq I	Thermus aquaticus	T C G A A G C T
Bam HI	Bacillus amyloliquefaciens	G G A T C C C C T A G G	Bgl II	Bacillus globiggi	A G A T C T T C T A G A
Eco RI	Escherichia coli	G A A T T C C T T A A G	Hin dIII	Hæmophilus influenzæ	A A G C T T T T C G A A
Eco RII	Escherichia coli	G C C T G G C C G G A C C G	Pst I	Providentia stuartii	C T G C A G G A C G T C

Source (les bases repérées en rouge sont celles impliquées dans le site de coupure)

Synthèse

Etes vous au top sur ce sujet ???
Pour le savoir quoi de mieux qu'un petit "devoir maison" ?