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  • des compléments concernant les cours, TP, TD...
  • des éléments de correction des évaluations...
  • des informations sur le baccalauréat, l'épreuve d'E.C.E, les T.P.E...

Et plein d'autes choses pour vous aider et vous permettre de mieux gérer votre travail personnel...
Un blog à visiter régulièrement, je vous conseille d'ailleurs de le faire au moins une fois par semaine pour récupérer les documents mis en ligne et enrichir ainsi votre cours ou vos CR de TP...
  

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Ci-dessous, vous trouverez les extraits des 15 dernières publications sur le blog. Cliquez sur les titres pour voir l'intégralité de l'article, afficher les images et avoir accès aux liens qu'il contient.

30 janvier 2008 3 30 /01 /janvier /2008 13:06
Cet article précise et complète les données vues dans le TP1.


Coupe transversale dans une feuille


 
Coupe transversale dans une feuille -
Source

 
Schéma légendé au niveau du faisceau conducteur -
Source

 
Coupe transversale dans une feuille au niveau du limbe -
Source

 
Schéma d'interprétation - Source


Zoom sur les stomates

 
Stomate de Bégonia - Source

 
Source

 
Stomate dans une CT de feuille -
Source

 
Source


Zoom sur les vaisseaux conducteurs de sève

 
Vaisseaux spiralés du Xylème (MO) - Source

 
Schéma d'interprétation -
Source

 
Xylème en MEB -
Source

 Le xylème se compose :

  • De deux types de cellules conductrices de sève : les vaisseaux constitués de files de cellules mortes dont les parois sont imprégnées de lignine ; en fonction du degré d'imprégnation de lignine , on distingue les vaisseaux ponctués ou réticulés. Les trachéides, moins riches en lignine, sont dites annelées ou spiralées. Les trachéides ne se transforment jamais en vaisseaux.
  • De fibres ligneuses, constituées de cellules mortes.
  • De parenchymes ligneux formés de cellules vivantes qui regroupent le parenchyme vertical et le parenchyme horizontal. Le premier est surtout présent dans le xylème secondaire et joue un rôle de réserve, le second forme des rayons ligneux et résulte de l'activité du cambium libéro-ligneux (méristème secondaire).

Le xylème permet la circulation de la sève brute constituée d'eau et de sels minéraux puisés dans le sol par les racines. Dans les vaisseaux la circulation se fait essentiellement verticalement et dans les trachéides la présence de paroi transversale provoque une circulation en chicane. Le xylème a aussi un rôle de soutien.

Le xylème primaire provient de la différenciation du méristème primaire. Dans l'organe en cours d'élongation apparaît du procambium, tissu méristématique dont certaines cellules se différencient en trachéides capable d'élongation (le protoxylème) et d'autres en vaisseaux (le métaxylème).

La différenciation du procambium n'est pas identique dans la tige et dans la racine. Elle est centripette dans les racines et centrifuge dans les tiges. Cette différence permet de distinguer une racine d'une tige.

Le xylème secondaire, ou bois, est caractérisé par un alignement radial de ses cellules du fait des caractéristiques de fonctionnement du cambium libéro-ligneux (méristème secondaire) : il se forme en position interne par rapport au cambium et mène à la formation de vaisseaux, de fibres, de parenchymes verticaux et horizontaux.

 
Tubes criblés du phloème coupe longitudinale (MO) -
Source

 
Schéma d'interprétation -
Source

 
Tubes criblés du phloème coupe transversale (MO) -
Source

 Le phloème

Comme le xylème, le phloème regroupe différents tissus :

  • Les tubes criblés, cellules vivantes allongées, qui ont des parois longitudinales et transversales possédant des pores appelés cribles. Ces cellules n'ont pas de noyau mais un contenu hyaloplasmique particulier avec des protéines allongées. Le plasmalemme persiste permettant des échanges.
  • Les cellules compagnes accolées aux tubes criblés.
  • Parenchymes libériens verticaux jouant un rôle de réserve, et horizontaux formant les rayon libériens et les fibres libériennes.

Le phloème a un rôle conducteur, il permet la conduction verticale de la sève élaborée qui est une solution riche en matière organique. Il a aussi un rôle de réserve avec les parenchymes et un rôle de soutien avec les fibres libériennes. On distingue le phloème primaire formé par différenciation des cellules procambiales, du phloème secondaire, à cellules alignées, formé par différenciation des cellules du cambium (assise génératrice libéro-ligneuse)


Circulation de la sève brute et sève élaborée :


Source
Trajet de la sève brute - Trajet de la sève élaborée

La sève brute (sève montante), solution de sels minéraux, absorbée au niveau des racines par les poils absorbants (radicelles), circule principalement dans le xylème, c'est-à-dire les vaisseaux du bois. Dans le tronc des arbres, les vaisseaux actifs se trouvent dans l'aubier (qui est la partie périphérique du bois, ceux du centre (le duramen) étant morts et jouant seulement un rôle de soutien grâce à la lignine. L'ascension de la sève brute peut dépasser largement, dans les très grands arbres, la hauteur de 10 m qui serait la limite d'un simple effet d'aspiration par le haut (aspiration foliaire). Cela s'explique principalement par le phénomène d'osmose permettant le transfert de liquides de concentrations différentes au travers de membranes semi-perméables (celles des cellules). 
Source
                      Section transversale schématique d'un tronc d'arbre

 La sève élaborée (sève descendante), qui contient des substances organiques solubles, principalement des acides aminés et des sucres, provient essentiellement des feuilles, siège de la photosynthèse, et circule principalement dans le phloème, tissu conducteur du liber, situé juste sous l'écorce. Les échanges se font aussi des feuilles vers les organes de réserves ou organes puits, fruits, graines, tubercules, ou à l'inverse en période de croissance, des organes de réserves vers les tiges en formation. 
N.B : il est rare qu'il y ait des flux de sève entre les fruits et les autres organes de la plante car les fruits sont des éléments indispensables pour la dispersion des graines et donc la pérennité de l'espèce; ils sont donc très protégés.
 
La sève élaborée est parfois prélevée par l'homme qui en tire des produits sucrés, la sève de bouleau, la sève du palmier à sucre (qui fournit le vin de palme)... Contrairement à une idée répandue, le sirop d'érable
, produit sucré, n'est pas tiré de la sève élaborée mais bien de la sève brute de l'Erable, qui, au printemps, se charge de sucres issus des tissus de réserves parenchymateuses, avant même que la photosynthèse n'ait repris son activité.

La position relative des vaisseaux du xylème et du phloème varie selon :
=> que la plante est une monocotylédone ou une dicotylédone
=> que la coupe est réalisée dans une tige, un pédoncule, un pétiole ou une racine

Généralement on colore la coupe au carmin vert d'iode ce qui fait que :
=> les vaisseaux du phloème dont la paroi est riche en cellulose apparaissent roses
=> les vaisseaux du xylème dont la paroi est riche en lignine apparaissent verts

Source
Faisceau conducteur de sève dans une CT de tige de Papyrus (monocotylédone)

Le xylème apparait constitué par de larges vaisseaux à parois épaisses colorées en vert
Le phloème constitué par de nombreux vaisseax à parois fines colorées en rose
Un cylindre de fibres formé par de toutes petites cellules à parois épaisses colorées en bleu entoure cette structure

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19 octobre 2007 5 19 /10 /octobre /2007 15:59
Petit test en ligne ou téléchargeable gratuitement pour voir ou revoir la structure de cet intermédiaire énergétique qu'est l'ATP : http://www.ac-creteil.fr/biotechnologies/main-biochemistry.htm

La fabrication de l'ATP sur Youtube :
Version simple : ATP Synthase Cartoon
Version plus élaborée : ATP synthesis
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19 octobre 2007 5 19 /10 /octobre /2007 10:25
1- La glycolyse :

C'est la dégradation du glucose en deux acides pyruviques
Elle se déroule dans le cytosol de la cellule
C'est une étape préliminaire à la fermentation et à la respiration 
Voir : http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/glyco1.html

Pour vous persuader que l'équation bilan donnée en cours est très simplifiée, visitez le lien suivant : http://cohen.svt.free.fr/biologie/glycolyse.gif (NAD+ / NADH, H+ = R' / R'H)

A télécharger sur la banque de schémas de SVT : http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=1279

2- Devenir de l'acide pyruvique lors des fermentations :

2-1 lors de la fermentation lactique :

Fermentation lactique Source
NAD+ / NADH = R'

2-2 lors de la fermentation alcoolique :

Fermentation alcoolique Source
NAD+ / NADH = R'
Une vidéo sur la fermentation alcoolique sur YouTube : In praise of yeast

3 - Devenir de l'acide pyruvique lors de la respiration : Le cycle de Krebs

Cycle de Krebs Source
Présentation simplifiée du cycle de Krebs (NADH et FADH = R'H)

Une autre présentation de ce cycle sur le lien suivant : http://cohen.svt.free.fr/biologie/krebs.gif

Le cycle de Krebs en vidéo sur Youtube : http://fr.youtube.com/watch?v=lvoZ21P4JK8&feature=related
Pour une présentation plus élaborée : voir le dossier sur le site de la facuté de Jussieu : http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/ck1.htm#etapesck
Le cycle de Krebs peut se décomposer schématiquement en trois étapes :
- étape 1 : préparation aux décarboxylations de la molécule à six carbones
- étape 2 : réactions de décarboxylations
- étape 3 : régénération de l'oxaloacétate qui acceptera à nouveau un acétyl-CoA. 

Bilan de la phosphorylation oxydative du glucose : http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Metabo/ch.%20resp.html#bilanglu 

A télécharger sur la banque de schémas de SVT : http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=1219

4- La réoxydation des transporteurs et la production d'énergie :

Voir sur le site LaboSvt.com une animation PowerPoint sur la chaîne oxydative (cliquer sur la diapo pour faire défiler les étapes) : http://www.labosvt.com/download-file-25.html

A télécharger sur la banque de schémas de SVT : 
http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=1216
http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=1224


5- Test en ligne :
 

Rendez-vous sur le site de l'Académie de Créteil : http://www.ac-creteil.fr/biotechnologies/main-biocell.htm
Vous y trouverez un test permettant de compléter une vue d'ensemble de la respiration cellulaire (glycolyse, cycle de krebs, chaîne respiratoire). Ce test réalisé par Laurent Martorell est jouable en ligne par un clic sur l'image ou téléchargeable.
Idéal pour une auto-évaluation et excellent comme schéma bilan fonctionnel

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21 septembre 2007 5 21 /09 /septembre /2007 12:53
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21 mars 2007 3 21 /03 /mars /2007 00:13

Dossier sur le métabolisme cellulaire :

Vous y retrouverez toutes les notions développées dans le cours et les TP

Rendez-vous sur le site : http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/sommaires/bbm.htm

Le métabolisme cellulaire humain : 

Document Acrobat reader (pdf)
Métabolisme : concepts de base
Description et contenu : notions générales sur le métabolisme. notion de catabolisme et d'anabolisme, de voie métabolique. notions de bioénergétique. notioin de régulation métabolique. 

Document Acrobat reader (pdf) Métabolisme : Phosphorylation oxydative
Description et contenu : rappel sur la mitochondrie. notion de potentiel redox et de couplage énergétique. description de la chaîne respiratoire. notion de couplage à un transfert de protons. couplage transfert de protons- production d'ATP. translocation de l'ATP dans le cytosol. navettes mitochondriales. inhibiteurs et découplants. régulation.


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21 mars 2007 3 21 /03 /mars /2007 00:07

Une première approche simple du phénomène : 

Certains végétaux terrestres et marins produisent en journée de l'oxygène par un processus naturel appelé photosynthèse. Explications. Voir

La Photosynthèse par les Expériences
 
Une étude de la photosynthèse réalisée à partir d'une collection d'expériences, vous y retrouverez celles proposées en TP.
Rendez-vous sur le site : http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Photosynthese/index.html  

Simulation de l'intensité photosynthétique (production O2/unité de tps) avec l'Elodée : Permet de faire varier l'intensité lumineuse, la nature de la radiation et laquantité de CO2. 
http://www.cambridgeassessment.org.uk/ca/Spotlight/Detail/Simulation_-_Water_Weed


Pour un cours complet sur la photosynthèse : 

Voir un dossier complet sur le site de la Faculté de Jussieu : http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Photosynthese-cours/index.htm


Des schémas bilan à télécharger sur la banque de schémas de SVT : 

Photosynthèse. Cycle de Calvin : détail des réactions chimiques
Photosynthèse. Cycle de Calvin : version simplifiée
Photosynthèse. Phase photochimique : chaîne de transport d’électrons (version simplifiée)
Photosynthèse. Phase photochimique : chaîne de transport d’électrons au niveau de la membrane du thylakoïde
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16 mars 2007 5 16 /03 /mars /2007 12:24

Le métabolisme humain modélisé

Des chercheurs du laboratoire du Pr. Bernhard Palsson à l'Université de Californie à San Diego ont construit le premier modèle complet du métabolisme du corps humain. Il connecte les gènes humains et leur produits à toutes les réactions connues de dégradation des nutriments et de synthèse des molécules du corps humain.
Ce modèle, disponible gratuitement sur le web et mis à jour régulièrement, constitue une avancée de taille pour un domaine de recherche en pleine expansion appelé Biologie des Systèmes.

Le modèle permet de déterminer au niveau du système global, les voies métaboliques affectées par les dérégulations de l'expression des gènes. L'une des applications les plus prometteuses, selon les chercheurs, consiste à utiliser ce modèle dans l'analyse des données issues de l'approche "puce à ADN". En effet, la comparaison de différents profils d'expression génique par exemple entre tissus normaux et malades génèrent des données extrêmement complexes et étalées sur tout le génome. Ce modèle permettrait de filtrer et condenser ces données leur permettant ainsi de révéler tous leurs secrets.
Des modèles similaires existent déjà pour le métabolisme d'organismes modèles comme la levure S. cerevisiae et la bactérie E. coli mais aucun modèle de qualité n'avait encore été publié pour l'homme.

La vocation de cet outil est de permettre de mieux comprendre les causes moléculaires de maladies telles que le cancer et en conséquence d'aider à trouver de nouvelles cibles pour le développement de nouveaux médicaments ainsi qu'à l'optimisation des médicaments déjà existants.

Aux Etats-Unis, un deuxième centre de références en Biologie des Systèmes se développe à Seattle, autour du nouveau "Institute for Systems Biology" dirigé par le Pr. Leroy Hood.

Voir le site (en anglais) : http://www.technologyreview.com/Biotech/18142/

Source de l'information : http://www.bulletins-electroniques.com/actualites/41379.htm

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31 janvier 2007 3 31 /01 /janvier /2007 18:35
Schémas particulièrements complets de la glycolyse et du cycle de Krebs. Nota : à utiliser pour dossier de recherche ?
La photosynthèse, un peu technique mais des liens intéressants - Nota : NADP = R
Excellent site recouvre le programme de TS spé et de l'ECE sur la photosynthèse
Un site canadien sur la métabolisme cellulaire
Métabolisme énergétique (respiration / fermentation)
Animations en rapport avec le métabolisme - à voir !
Cycle de Calvin et Benson
Chloroplastes et endosymbiose - pour un dossier de recherche ?
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30 janvier 2007 2 30 /01 /janvier /2007 14:38
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